Knjižnice, napisane v Nextflow u
rnaseq
Cev za analizo sekvenciranja RNK z uporabo STAR, RSEM, HISAT2 ali Salmon s štetjem genov/izoform in obsežnim nadzorom kakovosti.
- 646
- MIT
sarek
Analizni cevovod za odkrivanje zarodne linije ali somatskih variant (predhodna obdelava, klicanje variant in označevanje) iz WGS / ciljnega zaporedja.
- 256
- MIT
configs
Konfiguracijske datoteke, ki se uporabljajo za definiranje parametrov, specifičnih za računalniška okolja v različnih ustanovah (z nf-core).
- 71
- MIT